中国构建起目前全球最完整海洋微生物基因数据库

发布时间:2024-11-01 07:47:18 来源: sp20241101

   中新社 青岛9月5日电 (胡耀杰 张孝鹏)“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会5日在山东青岛举行。记者从会上获悉,华大生命科学研究院与山东大学等共同构建了目前全球最完整海洋微生物基因数据库The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC),并从中发现大量有应用潜力的基因资源。

  据华大生命科学研究院研究员范广益介绍,GOMC是已公开海洋基因组数据库Tara Ocean的3倍、蛋白序列库的60倍。目前,GOMC已存储于中国的国家基因库生命大数据平台,对具有应用潜力基因资源的相关研究成果已在学术期刊《自然》(Nature)上发表。

  据介绍,GOMC的构建过程中,科研人员对目前已公开的近240Tb海洋微生物宏基因组数据进行了重分析。GOMC拥有超4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿个基因序列,其中有2万余个微生物是潜在新发现物种,近1万个微生物是在独特生境中首次发现。

  GOMC的研究过程中,科研人员挖掘出1个具有潜在应用价值的新型Cas9编辑系统(Om1Cas9),将助力中国在基因编辑工具使用上具有更多独立性和选择;发现10个具有显著抗菌活性及广谱抗菌效果的新型抗菌肽,该成果的应用或将为抗生素耐药性难题提供新解决方案;发掘3个深海来源的高活性新型嗜盐PET塑料降解酶,或将助力实现PET塑料的绿色低碳可持续利用。

  据悉,GOMC是中国(山东)自贸试验区青岛片区与华大生命科学研究院所属青岛华大基因研究院共同开展的“千种海洋生物基因测序项目”重要组成部分。“千种海洋生物基因测序项目”主要内容为海洋生物的基因样本采集、高深度基因组测序等。(完) 【编辑:付子豪】